Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Smg6P61406 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smg6P61406 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smg6P61406 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smg6P61406 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smg6P61406 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Smg6P61406 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smg6P61406 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smg6P61406 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smg6P61406 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Smg6P61406 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Smg6P61406 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smg6P61406 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Smg6P61406 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smg6P61406 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smg6P61406 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms