Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme3P61290 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme3P61290 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme3P61290 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psme3P61290 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme3P61290 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme3P61290 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme3P61290 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme3P61290 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme3P61290 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme3P61290 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme3P61290 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme3P61290 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme3P61290 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme3P61290 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme3P61290 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme3P61290 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme3P61290 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme3P61290 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psme3P61290 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psme3P61290 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psme3P61290 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psme3P61290 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psme3P61290 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psme3P61290 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psme3P61290 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme3P61290 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psme3P61290 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms