Protein–RNA interactions for Protein: P60843

Eif4a1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif4a1P60843 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eif4a1P60843 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif4a1P60843 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eif4a1P60843 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eif4a1P60843 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eif4a1P60843 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eif4a1P60843 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms