Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia3P60469 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms