Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps5P59438 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps5P59438 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps5P59438 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps5P59438 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps5P59438 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hps5P59438 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hps5P59438 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hps5P59438 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps5P59438 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps5P59438 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps5P59438 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps5P59438 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps5P59438 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps5P59438 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps5P59438 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps5P59438 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps5P59438 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps5P59438 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps5P59438 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps5P59438 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps5P59438 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps5P59438 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps5P59438 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps5P59438 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps5P59438 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps5P59438 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps5P59438 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps5P59438 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps5P59438 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps5P59438 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps5P59438 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps5P59438 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps5P59438 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps5P59438 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps5P59438 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms