Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nphp4P59240 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms