Protein–RNA interactions for Protein: P59113

Fermt1, Fermitin family homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fermt1P59113 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fermt1P59113 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fermt1P59113 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fermt1P59113 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fermt1P59113 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fermt1P59113 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fermt1P59113 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fermt1P59113 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fermt1P59113 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fermt1P59113 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fermt1P59113 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fermt1P59113 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fermt1P59113 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fermt1P59113 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fermt1P59113 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fermt1P59113 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fermt1P59113 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fermt1P59113 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fermt1P59113 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fermt1P59113 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fermt1P59113 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fermt1P59113 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fermt1P59113 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fermt1P59113 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fermt1P59113 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fermt1P59113 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fermt1P59113 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fermt1P59113 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fermt1P59113 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fermt1P59113 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fermt1P59113 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fermt1P59113 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms