Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rhbdl3P58873 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms