Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P58686 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P58686 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P58686 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P58686 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P58686 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P58686 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P58686 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P58686 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P58686 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P58686 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P58686 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P58686 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P58686 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
P58686 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P58686 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P58686 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P58686 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P58686 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P58686 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P58686 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P58686 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P58686 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P58686 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P58686 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P58686 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P58686 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P58686 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P58686 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P58686 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P58686 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P58686 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P58686 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P58686 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P58686 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P58686 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P58686 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P58686 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P58686 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P58686 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P58686 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P58686 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P58686 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P58686 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P58686 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P58686 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P58686 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P58686 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P58686 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P58686 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P58686 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
P58686 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P58686 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P58686 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P58686 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P58686 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P58686 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P58686 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P58686 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P58686 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P58686 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P58686 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P58686 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P58686 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P58686 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P58686 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P58686 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P58686 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P58686 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P58686 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P58686 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P58686 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P58686 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P58686 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P58686 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P58686 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P58686 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P58686 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P58686 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P58686 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P58686 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P58686 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P58686 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P58686 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P58686 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P58686 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P58686 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P58686 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P58686 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P58686 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P58686 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P58686 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P58686 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P58686 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P58686 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P58686 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P58686 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P58686 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P58686 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P58686 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms