Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms