Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samsn1P57725 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Samsn1P57725 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms