Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NcstnP57716 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NcstnP57716 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NcstnP57716 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NcstnP57716 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NcstnP57716 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NcstnP57716 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NcstnP57716 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NcstnP57716 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NcstnP57716 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NcstnP57716 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NcstnP57716 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms