Protein–RNA interactions for Protein: P56657

Cyp2c40, Cytochrome P450 2C40, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c40P56657 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms