Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtskP55097 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtskP55097 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtskP55097 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtskP55097 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtskP55097 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtskP55097 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtskP55097 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtskP55097 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtskP55097 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtskP55097 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtskP55097 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtskP55097 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtskP55097 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtskP55097 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtskP55097 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtskP55097 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtskP55097 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtskP55097 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtskP55097 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtskP55097 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtskP55097 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtskP55097 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtskP55097 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CtskP55097 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtskP55097 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtskP55097 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtskP55097 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtskP55097 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtskP55097 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtskP55097 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtskP55097 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtskP55097 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtskP55097 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtskP55097 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtskP55097 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtskP55097 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtskP55097 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtskP55097 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtskP55097 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtskP55097 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtskP55097 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CtskP55097 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtskP55097 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtskP55097 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtskP55097 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtskP55097 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtskP55097 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtskP55097 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtskP55097 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtskP55097 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtskP55097 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtskP55097 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtskP55097 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtskP55097 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtskP55097 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtskP55097 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtskP55097 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtskP55097 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtskP55097 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtskP55097 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtskP55097 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtskP55097 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtskP55097 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtskP55097 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtskP55097 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CtskP55097 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtskP55097 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtskP55097 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtskP55097 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtskP55097 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtskP55097 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtskP55097 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtskP55097 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtskP55097 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtskP55097 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtskP55097 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtskP55097 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtskP55097 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtskP55097 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtskP55097 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtskP55097 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtskP55097 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtskP55097 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtskP55097 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtskP55097 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtskP55097 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtskP55097 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtskP55097 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtskP55097 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtskP55097 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtskP55097 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtskP55097 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CtskP55097 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CtskP55097 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CtskP55097 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CtskP55097 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CtskP55097 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CtskP55097 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CtskP55097 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms