Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cux1P53564 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cux1P53564 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cux1P53564 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cux1P53564 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cux1P53564 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cux1P53564 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cux1P53564 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cux1P53564 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cux1P53564 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cux1P53564 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cux1P53564 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cux1P53564 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cux1P53564 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cux1P53564 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Cux1P53564 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cux1P53564 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cux1P53564 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cux1P53564 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cux1P53564 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cux1P53564 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cux1P53564 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cux1P53564 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cux1P53564 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cux1P53564 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cux1P53564 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cux1P53564 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Cux1P53564 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cux1P53564 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cux1P53564 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cux1P53564 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Cux1P53564 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cux1P53564 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cux1P53564 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cux1P53564 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms