Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApodP51910 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApodP51910 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApodP51910 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApodP51910 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApodP51910 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ApodP51910 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApodP51910 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApodP51910 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApodP51910 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApodP51910 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApodP51910 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApodP51910 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApodP51910 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApodP51910 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApodP51910 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ApodP51910 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApodP51910 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApodP51910 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApodP51910 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApodP51910 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApodP51910 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApodP51910 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApodP51910 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApodP51910 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApodP51910 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApodP51910 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApodP51910 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApodP51910 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ApodP51910 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApodP51910 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApodP51910 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApodP51910 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApodP51910 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApodP51910 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApodP51910 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApodP51910 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApodP51910 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApodP51910 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApodP51910 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ApodP51910 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ApodP51910 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApodP51910 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ApodP51910 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApodP51910 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApodP51910 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApodP51910 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApodP51910 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApodP51910 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApodP51910 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApodP51910 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApodP51910 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApodP51910 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApodP51910 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApodP51910 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApodP51910 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApodP51910 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApodP51910 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApodP51910 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApodP51910 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApodP51910 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApodP51910 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApodP51910 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApodP51910 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApodP51910 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApodP51910 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApodP51910 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApodP51910 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApodP51910 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApodP51910 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApodP51910 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApodP51910 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ApodP51910 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApodP51910 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ApodP51910 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApodP51910 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApodP51910 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApodP51910 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApodP51910 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApodP51910 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApodP51910 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApodP51910 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApodP51910 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApodP51910 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ApodP51910 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ApodP51910 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ApodP51910 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApodP51910 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApodP51910 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApodP51910 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApodP51910 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApodP51910 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApodP51910 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApodP51910 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApodP51910 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApodP51910 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApodP51910 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApodP51910 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApodP51910 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApodP51910 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms