Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RoraP51448 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RoraP51448 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RoraP51448 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RoraP51448 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RoraP51448 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RoraP51448 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RoraP51448 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RoraP51448 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RoraP51448 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RoraP51448 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RoraP51448 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RoraP51448 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RoraP51448 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RoraP51448 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RoraP51448 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RoraP51448 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RoraP51448 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RoraP51448 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RoraP51448 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RoraP51448 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RoraP51448 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RoraP51448 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RoraP51448 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RoraP51448 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RoraP51448 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RoraP51448 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RoraP51448 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RoraP51448 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RoraP51448 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RoraP51448 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RoraP51448 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RoraP51448 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RoraP51448 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RoraP51448 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RoraP51448 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RoraP51448 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RoraP51448 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RoraP51448 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RoraP51448 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RoraP51448 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RoraP51448 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RoraP51448 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RoraP51448 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RoraP51448 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RoraP51448 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RoraP51448 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RoraP51448 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RoraP51448 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RoraP51448 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RoraP51448 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RoraP51448 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RoraP51448 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RoraP51448 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RoraP51448 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RoraP51448 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RoraP51448 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RoraP51448 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RoraP51448 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RoraP51448 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RoraP51448 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RoraP51448 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RoraP51448 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RoraP51448 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RoraP51448 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RoraP51448 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RoraP51448 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RoraP51448 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RoraP51448 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RoraP51448 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RoraP51448 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RoraP51448 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RoraP51448 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RoraP51448 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RoraP51448 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RoraP51448 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RoraP51448 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RoraP51448 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RoraP51448 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RoraP51448 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RoraP51448 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RoraP51448 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RoraP51448 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RoraP51448 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RoraP51448 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RoraP51448 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RoraP51448 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RoraP51448 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RoraP51448 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RoraP51448 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RoraP51448 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RoraP51448 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RoraP51448 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RoraP51448 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RoraP51448 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RoraP51448 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RoraP51448 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RoraP51448 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RoraP51448 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RoraP51448 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms