Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnnt2P50752 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnnt2P50752 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnnt2P50752 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnnt2P50752 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt2P50752 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt2P50752 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt2P50752 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt2P50752 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt2P50752 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt2P50752 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt2P50752 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt2P50752 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt2P50752 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt2P50752 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt2P50752 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt2P50752 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt2P50752 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt2P50752 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt2P50752 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt2P50752 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms