Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TspoP50637 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TspoP50637 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TspoP50637 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TspoP50637 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TspoP50637 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TspoP50637 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TspoP50637 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TspoP50637 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TspoP50637 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TspoP50637 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TspoP50637 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TspoP50637 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TspoP50637 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TspoP50637 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TspoP50637 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TspoP50637 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TspoP50637 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TspoP50637 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TspoP50637 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TspoP50637 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TspoP50637 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TspoP50637 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TspoP50637 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TspoP50637 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TspoP50637 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TspoP50637 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TspoP50637 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TspoP50637 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TspoP50637 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TspoP50637 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TspoP50637 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TspoP50637 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TspoP50637 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TspoP50637 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TspoP50637 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TspoP50637 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TspoP50637 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TspoP50637 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TspoP50637 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TspoP50637 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TspoP50637 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TspoP50637 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TspoP50637 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TspoP50637 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TspoP50637 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TspoP50637 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TspoP50637 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TspoP50637 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TspoP50637 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TspoP50637 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TspoP50637 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TspoP50637 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TspoP50637 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TspoP50637 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TspoP50637 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TspoP50637 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TspoP50637 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TspoP50637 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TspoP50637 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TspoP50637 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TspoP50637 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TspoP50637 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TspoP50637 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TspoP50637 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TspoP50637 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TspoP50637 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TspoP50637 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TspoP50637 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TspoP50637 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TspoP50637 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TspoP50637 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TspoP50637 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TspoP50637 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TspoP50637 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TspoP50637 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TspoP50637 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TspoP50637 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TspoP50637 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TspoP50637 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TspoP50637 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TspoP50637 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TspoP50637 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TspoP50637 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TspoP50637 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TspoP50637 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TspoP50637 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TspoP50637 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TspoP50637 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TspoP50637 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TspoP50637 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TspoP50637 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TspoP50637 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TspoP50637 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TspoP50637 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TspoP50637 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TspoP50637 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TspoP50637 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TspoP50637 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TspoP50637 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms