Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ercc3P49135 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms