Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Brca1P48754 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brca1P48754 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brca1P48754 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brca1P48754 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brca1P48754 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brca1P48754 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms