Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms