Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rfx2P48379 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms