Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl11P48298 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl11P48298 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms