Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SrprbP47758 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrprbP47758 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrprbP47758 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrprbP47758 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrprbP47758 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrprbP47758 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrprbP47758 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrprbP47758 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrprbP47758 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrprbP47758 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SrprbP47758 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms