Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klf1P46099 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klf1P46099 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klf1P46099 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klf1P46099 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klf1P46099 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klf1P46099 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klf1P46099 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klf1P46099 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf1P46099 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klf1P46099 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klf1P46099 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klf1P46099 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klf1P46099 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Klf1P46099 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms