Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syt1P46096 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syt1P46096 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syt1P46096 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syt1P46096 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syt1P46096 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syt1P46096 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syt1P46096 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syt1P46096 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syt1P46096 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syt1P46096 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms