Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms