Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Mmp9P41245 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Mmp9P41245 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Mmp9P41245 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Mmp9P41245 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Mmp9P41245 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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