Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ThpoP40226 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ThpoP40226 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ThpoP40226 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ThpoP40226 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ThpoP40226 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ThpoP40226 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ThpoP40226 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms