Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tjp1P39447 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tjp1P39447 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tjp1P39447 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tjp1P39447 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tjp1P39447 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tjp1P39447 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tjp1P39447 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tjp1P39447 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tjp1P39447 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tjp1P39447 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tjp1P39447 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tjp1P39447 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tjp1P39447 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tjp1P39447 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tjp1P39447 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tjp1P39447 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tjp1P39447 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tjp1P39447 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tjp1P39447 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tjp1P39447 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tjp1P39447 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tjp1P39447 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tjp1P39447 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tjp1P39447 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tjp1P39447 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tjp1P39447 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tjp1P39447 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tjp1P39447 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tjp1P39447 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tjp1P39447 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tjp1P39447 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tjp1P39447 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tjp1P39447 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tjp1P39447 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tjp1P39447 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tjp1P39447 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tjp1P39447 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tjp1P39447 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tjp1P39447 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tjp1P39447 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tjp1P39447 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tjp1P39447 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tjp1P39447 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tjp1P39447 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tjp1P39447 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tjp1P39447 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tjp1P39447 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tjp1P39447 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tjp1P39447 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tjp1P39447 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms