Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik2P39087 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik2P39087 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik2P39087 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik2P39087 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik2P39087 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik2P39087 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik2P39087 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik2P39087 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik2P39087 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Grik2P39087 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik2P39087 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms