Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Col18a1P39061 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col18a1P39061 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms