Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lig1P37913 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lig1P37913 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lig1P37913 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lig1P37913 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lig1P37913 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms