Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PpardP35396 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PpardP35396 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PpardP35396 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PpardP35396 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PpardP35396 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PpardP35396 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PpardP35396 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PpardP35396 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PpardP35396 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PpardP35396 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PpardP35396 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PpardP35396 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PpardP35396 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PpardP35396 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PpardP35396 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PpardP35396 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PpardP35396 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PpardP35396 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PpardP35396 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PpardP35396 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PpardP35396 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PpardP35396 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PpardP35396 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PpardP35396 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PpardP35396 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PpardP35396 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PpardP35396 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PpardP35396 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PpardP35396 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PpardP35396 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PpardP35396 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PpardP35396 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PpardP35396 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PpardP35396 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PpardP35396 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PpardP35396 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PpardP35396 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PpardP35396 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PpardP35396 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PpardP35396 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PpardP35396 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PpardP35396 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PpardP35396 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PpardP35396 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PpardP35396 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PpardP35396 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PpardP35396 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PpardP35396 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PpardP35396 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PpardP35396 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PpardP35396 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PpardP35396 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PpardP35396 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PpardP35396 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PpardP35396 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PpardP35396 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PpardP35396 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PpardP35396 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PpardP35396 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PpardP35396 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PpardP35396 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PpardP35396 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PpardP35396 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PpardP35396 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PpardP35396 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PpardP35396 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PpardP35396 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PpardP35396 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PpardP35396 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PpardP35396 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PpardP35396 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PpardP35396 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PpardP35396 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PpardP35396 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PpardP35396 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PpardP35396 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PpardP35396 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PpardP35396 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PpardP35396 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PpardP35396 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PpardP35396 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PpardP35396 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PpardP35396 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PpardP35396 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PpardP35396 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PpardP35396 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PpardP35396 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PpardP35396 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PpardP35396 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PpardP35396 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PpardP35396 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PpardP35396 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PpardP35396 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PpardP35396 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PpardP35396 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PpardP35396 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PpardP35396 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PpardP35396 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PpardP35396 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms