Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab20P35295 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab20P35295 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab20P35295 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab20P35295 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab20P35295 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab20P35295 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab20P35295 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab20P35295 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rab20P35295 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rab20P35295 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms