Protein–RNA interactions for Protein: P35276

Rab3d, Ras-related protein Rab-3D, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3dP35276 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms