Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp12P34960 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp12P34960 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms