Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifnar1P33896 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ifnar1P33896 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ifnar1P33896 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifnar1P33896 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ifnar1P33896 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ifnar1P33896 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifnar1P33896 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifnar1P33896 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifnar1P33896 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifnar1P33896 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifnar1P33896 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifnar1P33896 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifnar1P33896 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifnar1P33896 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifnar1P33896 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms