Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc5P32043 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms