Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc10P31257 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Hoxc10P31257 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms