Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Etv4P28322 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Etv4P28322 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Etv4P28322 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Etv4P28322 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Etv4P28322 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Etv4P28322 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Etv4P28322 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Etv4P28322 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Etv4P28322 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Etv4P28322 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Etv4P28322 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms