Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LoxP28301 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LoxP28301 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LoxP28301 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LoxP28301 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LoxP28301 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LoxP28301 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LoxP28301 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LoxP28301 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LoxP28301 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LoxP28301 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LoxP28301 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LoxP28301 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LoxP28301 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LoxP28301 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LoxP28301 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LoxP28301 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LoxP28301 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LoxP28301 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LoxP28301 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LoxP28301 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LoxP28301 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LoxP28301 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LoxP28301 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LoxP28301 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LoxP28301 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LoxP28301 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LoxP28301 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LoxP28301 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LoxP28301 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LoxP28301 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LoxP28301 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LoxP28301 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LoxP28301 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LoxP28301 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LoxP28301 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LoxP28301 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LoxP28301 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LoxP28301 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LoxP28301 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LoxP28301 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LoxP28301 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LoxP28301 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LoxP28301 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LoxP28301 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LoxP28301 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LoxP28301 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LoxP28301 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LoxP28301 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LoxP28301 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LoxP28301 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LoxP28301 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LoxP28301 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LoxP28301 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LoxP28301 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LoxP28301 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LoxP28301 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LoxP28301 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LoxP28301 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LoxP28301 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LoxP28301 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LoxP28301 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LoxP28301 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LoxP28301 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LoxP28301 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LoxP28301 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LoxP28301 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LoxP28301 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LoxP28301 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LoxP28301 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LoxP28301 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LoxP28301 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LoxP28301 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LoxP28301 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LoxP28301 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LoxP28301 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LoxP28301 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LoxP28301 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LoxP28301 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LoxP28301 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LoxP28301 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LoxP28301 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LoxP28301 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LoxP28301 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LoxP28301 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LoxP28301 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LoxP28301 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LoxP28301 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LoxP28301 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LoxP28301 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LoxP28301 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LoxP28301 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LoxP28301 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LoxP28301 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LoxP28301 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LoxP28301 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LoxP28301 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LoxP28301 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LoxP28301 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LoxP28301 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms