Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde6aP27664 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms