Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2afxP27661 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afxP27661 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2afxP27661 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afxP27661 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2afxP27661 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2afxP27661 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2afxP27661 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
H2afxP27661 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2afxP27661 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2afxP27661 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2afxP27661 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2afxP27661 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2afxP27661 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2afxP27661 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2afxP27661 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2afxP27661 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2afxP27661 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2afxP27661 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2afxP27661 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
H2afxP27661 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2afxP27661 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2afxP27661 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms