Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rpl3P27659 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl3P27659 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl3P27659 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl3P27659 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl3P27659 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl3P27659 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl3P27659 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl3P27659 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl3P27659 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl3P27659 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl3P27659 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl3P27659 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl3P27659 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl3P27659 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl3P27659 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl3P27659 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl3P27659 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl3P27659 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl3P27659 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl3P27659 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl3P27659 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl3P27659 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms