Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Tgfb2P27090 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms