Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af2P26369 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af2P26369 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af2P26369 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af2P26369 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af2P26369 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af2P26369 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2af2P26369 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms