Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CftrP26361 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CftrP26361 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CftrP26361 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CftrP26361 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CftrP26361 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CftrP26361 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CftrP26361 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CftrP26361 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CftrP26361 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CftrP26361 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CftrP26361 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CftrP26361 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
CftrP26361 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CftrP26361 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CftrP26361 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CftrP26361 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CftrP26361 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CftrP26361 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CftrP26361 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CftrP26361 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CftrP26361 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CftrP26361 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CftrP26361 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CftrP26361 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CftrP26361 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CftrP26361 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CftrP26361 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CftrP26361 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CftrP26361 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CftrP26361 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CftrP26361 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CftrP26361 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CftrP26361 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CftrP26361 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CftrP26361 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CftrP26361 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CftrP26361 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CftrP26361 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CftrP26361 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CftrP26361 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CftrP26361 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CftrP26361 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CftrP26361 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CftrP26361 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CftrP26361 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CftrP26361 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CftrP26361 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CftrP26361 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CftrP26361 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CftrP26361 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CftrP26361 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
CftrP26361 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CftrP26361 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CftrP26361 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CftrP26361 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CftrP26361 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CftrP26361 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CftrP26361 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CftrP26361 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
CftrP26361 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CftrP26361 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CftrP26361 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CftrP26361 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CftrP26361 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
CftrP26361 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CftrP26361 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CftrP26361 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CftrP26361 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CftrP26361 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CftrP26361 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CftrP26361 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CftrP26361 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
CftrP26361 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CftrP26361 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CftrP26361 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CftrP26361 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
CftrP26361 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CftrP26361 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CftrP26361 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CftrP26361 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CftrP26361 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CftrP26361 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CftrP26361 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CftrP26361 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CftrP26361 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CftrP26361 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CftrP26361 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CftrP26361 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CftrP26361 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CftrP26361 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CftrP26361 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CftrP26361 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CftrP26361 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CftrP26361 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CftrP26361 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CftrP26361 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CftrP26361 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CftrP26361 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CftrP26361 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms