Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna1P26231 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms